紫苑镇——玲奈在收拾富士爷爷的房间时无意中发现了一张照片，照片的人看起来是一家三口，爸爸妈妈中间有一个手里拿着帽子的可爱小女孩穿着白色的衣服。

“玲奈，你在看什么？”富士爷爷走了进来。

“富士爷爷，这张照片是？”玲奈自然的问道。

富士爷爷从玲奈手里接过照片说道：“那是我和我妻子、女儿。”

“那她们现在在哪儿？”

富士爷爷拿着照片走到窗前说道：“我女儿早夭（死了的意思），妻子也离开了我。”

“对不起…”玲奈意识到她让富士爷爷想起伤心的事，羞愧的了低下头道歉。

“没什么好道歉的，‘是我的错’。”富士爷爷看了看天空，“要变天了。——小智你遇到它的话一定要拯救它啊……我把一切都赌在你身了……”

天空突然下起了大雨，小智一行人收到新岛的邀请函，来到了位于新岛的码头——“老海岸码头”。当一行人到达码头的大厅时，早已是人山人海，连坐的地方都没有。

小霞拿出一块毛巾帮波克比擦雨水，抱怨道：“天气本来很好的嘛！怎么会…”

“人家都说海边的气候最善变了。”小刚看向天花板。

“皮卡丘，小心别感冒了。”小智也是赶紧帮皮卡丘擦雨水。

“咦！渡船停航？”，“不能去新岛了吗？”，“怎么这样……”

君莎小姐正在安抚众人，“各位请安静，这位就是管理码头的…”

“我是波佳，想了解大海的情况，就去听听大海的声音吧——不过也不需要去听了，你们看这么阴沉的天，这样的飓风还从来没见过。”蓝发的女士说道。

“有这么可怕吗？”

波佳继续说道：“连我在港口长大的人，都没经历过这样大的暴风雨。而且暴风雨就笼罩在这新岛的空呀，我是不可能让各位去冒险的，这是本人保护港口的职责。”

“就是这样，所以渡船取消航行了。”港口的管理员波佳认为今天的风浪异常大，建议大家不要出海。

“没问题的，我的宝可梦，我的宝可梦水性很好，它一定有办法渡海的。”一个穿蓝色衣服稍微胖的男生说道。

“等一下！我这么了解海洋，我都说不行了。”港口管理员波佳为了不让宝可梦和他们遭到任何的意外，坚决不让众人出航。

“是呀！万一宝可梦受伤了，也没有办法在宝可梦中心，为它治疗呀！”君莎小姐也赞同波佳的看法。

“为什么呢？”小智出面问道。

“宝可梦中心的乔伊小姐她失踪了，没有乔伊小姐就不能治疗宝可梦，那边的海报就是寻人启事。”君莎小姐头转向墙的海报解释说。

小刚觉得海报的乔伊小姐好像在哪见过，大家都没在意，因为乔伊小姐都长得一样。（不过只有小刚分得清）

很多训练家收到新岛主人的邀请函，便来到这里乘坐船去新岛，但是这里的管理员波佳认为今天的风浪异常大，建议大家不要出海。可是热情的训练家们跟本不顾君莎和波佳的反对，自行使用宝可梦去新岛——先是一个橙色衣服的男生骑着大比鸟（比雕），一个女生乘着白海狮，之前那个蓝衣男生骑着一只暴鲤龙，还有许多训练家拿出自己的宝可梦接二连三的朝着新岛出发。