一九四四年底的时候，日军开始侵入贵省，这让贵省人心惶惶，同时，浙江大学的办学由于日军的入侵也陷于停顿。

由于交通极为不便，一九四四年暑期的时候，李政道便随着束星北教授去了山城，并在山城与家人团聚，最后，李政道听从了束星北教授的建议，为转学西南联大进行准备工作。

李政道在山城和束星北教授告别的时候，束星北教授送了李政道一本琼斯写的电磁学名着，这是琼斯当年在英吉利国苏格兰爱丁堡大学，随达尔文教授做研究时所用的。

虽然李政道在浙江大学只读了一年的书，但在束星北教授和王淦昌教授等名师的悉心指导和潜移默化的影响下，李政道已经对物理学整体有了一定了解，特别是在与束星北教授一对一的讨论学习中，激发了李政道从事物理学研究的热情。

一九四五年春，李政道带着对物理学的深切热爱，在经人介绍后，转学至西南联大物理系二年级就读。

一九四五年春的一天，忽然有个不到二十岁的胖胖的孩子拿着一封介绍信来找物理系主任吴大猷，那时，正好是学年的中间，新来的学生如果不经过考试的话是不能转学的。

于是，西南联合大学的物理系主任吴大猷便和西南联合大学中教大学二年级物理、数学课的几位老师商量，让李政道随班听讲、考试，并商定李政道如果考试及格的话，就等到暑假的时候正式转入二年级，可免读以前的课程。

而西南联合大学堪称华夏近现代教育史上的一个奇迹，特别是西南联合大学的物理学科更是一流。

虽然由于战争的原因，西南联合大学的物质条件虽然艰苦，但是西南联合大学却是云集了大批的名师，学校内的学术研究气氛非常的浓厚，在叶企孙、吴有训、饶毓泰、周培源、吴大猷等老师的影响下，西南联合大学物理系坚持着眼世界科学前沿开展教学和研究，充满了朝气和自信。

大师云集的西南联合大学物理系对于李政道而言，可谓如鱼得水，其天赋和才能很快便显露出来。

李政道的勤奋和天资也让西南联合大学物理系主任吴大猷教授非常的惊讶，并称李政道为华夏物理学的“奇才”。

李政道应付西南联合大学物理系的课程属于是绰绰有余，并且，西南联合大学物理系主任吴大猷教授从李政道做题的步骤和方法上，很快便发现了李政道思维敏捷的程度大大异乎常人。

尽管李政道在西南联合大学物理系中只度过了短短一年的时间，但李政道的天资和才华却已显露出来，

一九四五年秋的时候，华夏政府的原子弹计划及“种子计划”正式启动，西南联合大学物理系主任吴大猷教授获准带两名年轻的助手一同前往美丽国学习原子技术，而且这两名助手则是由西南联合大学物理系主任吴大猷教授自己亲自挑选。