由于风后的奇谋兵阵轮番使用，加之蚩尤不得人心，大军一路势如破竹，很快就到达涿鹿。

决战时刻到了。轩辕黄帝手持雷兽鼓槌，擂击夔皮战鼓，顿时鼓声震天。蚩尤感觉鼓声击心时，他的八十一位兄弟个个身体如同山崩石塌，身体就像碎石一样一块一块往下掉，最后整个庞大身躯化为一堆石粉，被微微的风一下就吹散了。

蚩尤见势不妙，立即运起爬云术，一下跳到了半空，架起云朵连忙逃窜，一瞬间不见了踪影。

此等好机会，哪有错过的道理？应龙与风后各自对望一眼，架起轩辕黄帝升到半空，令凤凰将80面馗牛皮战鼓依次重叠起来，令腾蛇将160根雷兽棒紧紧卷在一起，三人同时发力，将千万年的修为和功力尽数用在敲击上，只听一声地动山摇的惊天爆响，天地失色、日月无光，已经飞到冀州中部的蚩尤应声落地，被赶上来的毕方叨到嘴里，捉了回来。

再说那风伯方天君、雨师赤松子和九黎部落士兵，早就见识了轩辕黄帝仁爱心慈，他们都是因为蚩尤的裹挟而不得不参战，并且也看到了蚩尤的残暴，如今主帅被擒，哪里还有再战勇气？纷纷抛下武器，伏地跪拜新主。

捉住蚩尤以后，轩辕黄帝命人给蚩尤戴上枷栲，在黎山之丘处死了他。为了防止蚩尤死后作怪，黄帝命人把他的头埋在了东平寿张的阚地，把他的身体埋在泰山南面的巨野，蚩尤身上的枷栲，取下来后被抛掷在大荒之中的宋山上，后来化作一片枫树林。

打败蚩尤之后，黄帝又派应龙杀死夸父。一时间，华夏苍穹之下，无不归顺臣服，各部落一致承认黄帝取代炎帝神农氏，成为天下共主，轩辕黄帝也成为华夏民族的始祖，开启了中华文明的序幕。